北京热带医学研究所创建于1978年，是我国成立最早、北方地区唯一的热带医学专业研究机构，首任所长为中国科学院院士、我国热带医学奠基人、北京友谊医院首任院长钟惠澜教授。叶剑英元帅亲笔为研究所题名。

上世纪50年代，钟惠澜院士倡导成立热带病研究室，聚焦黑热病、钩虫病、回归热和肺吸虫病等多种热带病开展研究，为研究所独立建制筑牢了坚实的学科与人才根基。自成立以来，研究所始终坚守“全球观、卫生观和科学观”的核心理念，秉持“临床与科研并重、防治与研究结合”的发展方向，历经近半个世纪的积淀，构建起集科学研究、临床诊疗、现场防治、宣教培训与人才培养于一体的完整学科体系，成为我国热带病防控领域的重要力量。

在临床诊疗与技术创新方面，研究所构建了完整的技术体系，形成“五位一体”诊疗模式和“急诊-门诊-病房”全流程患者管理模式，可精准诊治麻风病、输入性疟疾、黑热病及各类食源性寄生虫病等多种热带病。其中，李桓英研究员团队开展的麻风病防治研究荣获国家科学技术进步一等奖，其推广的“短程联合化疗”方案被世界卫生组织在全球推广，为我国乃至世界麻风病危害的消除做出突出贡献。研究所承担北京市重症疟疾救治任务，累计诊治数千例输入性疟疾病例，2022年获评“全国消除疟疾工作先进集体”。在2006年北京广州管圆线虫病疫情处置等重大公共卫生事件中发挥关键作用，被确立为全国该疾病监测中心之一，是国家临床重点专科（地方病科）。

此外，研究所建立起44项热带病相关病原体的检测技术体系。 研究所拥有一支结构合理的专业团队，涵盖临床医学、病原生物学、生物信息学等多个领域，形成以资深专家为引领、中青年骨干为主体的人才梯队。科研工作方面，团队聚焦病原体致病机制前沿，在细菌毒素分泌系统和弓形虫线粒体核糖体的组装等领域取得重要突破，成果发表于Nature Communications，PLOS Pathogens等国际知名期刊。自主研发多项检测技术，并获11项国家发明专利。研究所还拥有国家中医药管理局中医药科研三级实验室（病原生物学实验室）、热带病防治研究北京市重点实验室等平台，配备先进仪器并实行开放共享，为科研与临床工作提供坚实支撑。同时常态化开展麻风病、疟疾等热带病的健康科普，通过主题宣传、重点人群培训、编制防治手册等方式，构建起覆盖公众、基层医疗机构、国有企事业单位和政策咨询的公共服务体系。

作为我国热带病领域最早参与国际合作的机构之一，自1980年起，研究所先后被世界卫生组织认定为利什曼病、肺吸虫病、肝吸虫病及囊虫病合作中心，先后与国内外知名机构建立了深度合作关系，包括：美国科罗拉多州立大学、美国国立卫生研究院、美国约翰斯•霍普金斯大学、美国贝勒医学院、英国华威大学、国家疾病预防控制中心、中国医学科学院皮肤病研究所等，共同开展科研课题研究。 面向未来，北京热带医学研究所将立足学科前沿与国家战略需求，秉承严谨学风与专业担当，持续深化科研创新、优化诊疗体系、强化人才培养，加强新发再发病原体监测，提升公共卫生应急与合作水平，为我国乃至全球热带病防治事业持续贡献力量。